不会。

医保个人账户的资金是不会被清零的。当然也一般只有职工基本医疗保险才会有医保个人账户，参与职工基本医疗保险的用户缴纳的保费是由单位和职工本人共同缴纳的，其中单位缴纳的金额进入到医保共济账户，个人缴纳的金额是进入到医保个人账户的。

医保个人账户的资金除非是用户自己在定点的药店、门诊或者医院进行了支付，否则是不会随着时间的增加而被清零的。进入到医保个人账户的资金是属于用户本人的。一般医保报销后的需要个人自付的医疗费用也是可以直接使用医保个人账户资金来完成支付的。此外，现在不少地区推出的补充性商业医疗保险也是可以使用医保个人账户来付款的。